Τα μαθήματα και οι αντίστοιχες πιστωτικές μονάδες / ECTS ορίζονται ως εξής:

1ο Εξάμηνο Σπουδών

(κοινό και για τις δύο κατευθύνσεις εξειδίκευσης)

• Υδάτινο περιβάλλον (4 ECTS)
• Βιολογία εκτρεφόμενων υδρόβιων οργανισμών (3 ECTS)
• Συστήματα Υδατοκ/γειών (4 ECTS)
• Αναπαραγωγή και Γενετική (2 ECTS)
• Γενικές αρχές Ιχθυοπαθολογίας και Διαγνωστικής (3 ECTS)
• Μεσογειακή Διατροφή (4 ECTS)
• Διασφάλιση και Διαχείριση ποιότητας στις υδατοκ/γειες - συστήματα HACCP (2 ECTS)
• Eιδικές διαλέξεις/ εφαρμοσμένη στατιστική (3 ECTS)
• Βιβλιογραφική εργασία (5 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS 

2ο Εξάμηνο Σπουδών

«Εξειδίκευση: Υδατοκαλλιέργειες»

• Σχεδιασμός μονάδων εκτροφής (3 ECTS)
• Σχεδιασμός εκκολαπτηρίων (3 ECTS)
• Διαχείριση γεννητόρων και Γενετική (2 ECTS)
• Αρχές Διατροφής ζωικών οργανισμών (5 ECTS)
• Διαχείριση λιμνοθαλασσών (3 ECTS)
• Εφαρμοσμένη Διατροφή (5 ECTS)
• Εργαστηριακή άσκηση/ εκπαιδευτικές επισκέψεις (9 ECTS)

«Εξειδίκευση: Παθολογικά προβλήματα εκτρεφόμενων υδρόβιων οργανισμών»:

• Λοιμώδη νοσήματα ιχθύων I (Μικροβιολογία) (5 ECTS)
• Λοιμώδη νοσήματα ιχθύων II (Παρασιτικά νοσήματα) (4 ECTS)
• Λοιμώδη νοσήματα ιχθύων III (Iοί, Ρικέτσιες και Χλαμύδιες), Νοσήματα οφειλόμενα σε μη μολυσματικά αίτια (4 ECTS)
• Βασικές αρχές Ανοσολογίας Ιχθύων (4 ECTS)
• Βασικές αρχές Παθολογικής Ανατομικής (3 ECTS)
• Παθολογική Ανατομική Υδρόβιων Οργανισμών (3 ECTS)
• Ειδικές διαλέξεις/σεμινάρια/ πρακτική άσκηση (7 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS

3ο Εξάμηνο Σπουδών

• Αρχές Φαρμακολογίας και Θεραπευτικής (3 ECTS)
• Πρόληψη, Θεραπεία και Τοξικότητα στο υδάτινο περιβάλλον (3 ECTS)
• Υγιεινή αλιευμάτων, δίθυρων και προϊόντων υδατ/γειας (3 ECTS)
• Σεμινάρια/Εκπαιδευτικές επισκέψεις (6 ECTS)
• Ερευνητική εργασία και εξάσκηση σε προχωρημένες εργαστηριακές τεχνικές (15 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS

Το Μεταπτυχιακό Δίπλωμα Ειδίκευσης (ΜΔΕ) απονέμεται μετά την συμπλήρωση 120 πιστωτικών μονάδων (ECTS) σε κάθε κατεύθυνση.

Η γλώσσα διδασκαλίας του Π.Μ.Σ είναι η ελληνική ή η αγγλική. Η γλώσσα εκπόνησης διπλωματικής εργασίας είναι η ελληνική.