Για τη λήψη του Διπλώματος Μεταπτυχιακών Σπουδών απαιτείται:
α) παρακολούθηση και επιτυχής εξέταση όλων των μεταπτυχιακών μαθημάτων τα οποία πιστώνονται συνολικά με εβδομήντα πέντε (75) ECTS 
β) συμμετοχή σε πρακτική άσκηση στην Παιδιατρική Κλινική του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας είτε σε δομή Πρωτοβάθμιας Φροντίδας Υγείας που ασχολείται με τον τομέα της Παιδιατρικής η οποία πιστώνεται δεκαπέντε (15) ECTS και
γ) η συγγραφή μεταπτυχιακής εργασίας κατά το 4o εξάμηνο σπουδών η οποία πιστώνεται με τριάντα (30) ECTS.

Η δομή του προγράμματος είναι η ακόλουθη:

1ο εξάμηνο σπουδών

•     Γενική Παιδιατρική (4 ECTS)
•     Παιδιατρική στην Πρωτοβάθμια Φροντίδα Υγείας (3 ECTS)
•     Επείγουσες καταστάσεις στην Παιδιατρική - Πρώτες Βοήθειες (3 ECTS)
•     Αναπτυξιακή και συμπεριφορική Παιδιατρική (3 ECTS)
•     Φαρμακολογία – Φάρμακα 1ης γραμμής στην Παιδιατρική - Ορθολογική χρήση αντιβιοτικών στην πρωτοβάθμια περίθαλψη (3 ECTS)
•     Σύγχρονες εργαστηριακές τεχνικές τεκμηρίωσης παθογόνων μικροοργανισμών - Απεικονιστικός έλεγχος στα παιδιά (3 ECTS)
•     Παιδιατρική Νοσηλευτική φροντίδα (3 ECTS)
•     Νεογνολογία (3 ECTS)
•     Πρακτική άσκηση (5 ECTS)

Σύνολο μονάδων (ECTS) 30

2ο εξάμηνο σπουδών

•     Μικροβιακές λοιμώξεις (4 ECTS)
•     Ιογενείς λοιμώξεις (3 ECTS)
•     Εμβολιασμοί στον παιδιατρικό πληθυσμό και σε ειδικές ομάδες (3 ECTS)
•     Ειδικές λοιμώξεις στην κοινότητα (3 ECTS)
•     Πνευμονολογία (3 ECTS)
•     Σεξουαλικώς μεταδιδόμενα νοσήματα στην Εφηβική Γυναικολογία (3 ECTS)
•     Συγγενείς και περιγεννητικές λοιμώξεις (3 ECTS)
•     Αλλεργιολογία και Δερματολογικά νοσήματα (3 ECTS)
•     Πρακτική άσκηση (5 ECTS)

Σύνολο μονάδων (ECTS) 30

3ο εξάμηνο σπουδών

•     Ρευματολογία – ανοσολογία (3 ECTS)
•     Νευρολογικά νοσήματα (3 ECTS)
•     Συγγενείς καρδιοπάθειες - Παιδορθοπαιδικά προβλήματα (3 ECTS)
•     Γαστρεντερολογικά νοσήματα (3 ECTS)
•     Οφθαλμολογικά προβλήματα παιδιών - Παιδο-ωτορινολαρυγγολογικά νοσήματα (3 ECTS)
•     Ενδοκρινολογικά προβλήματα – Μεταβολικό σύνδρομο – Διαβήτης (3 ECTS)
•     Παιδοχειρουργικά (2 ECTS)
•     Νοσήματα του ουροποιητικού (3 ECTS)
•     Βιοστατιστική - Μεθοδολογία Έρευνας (2 ECTS)
•     Πρακτική άσκηση (5 ECTS)

Σύνολο μονάδων (ECTS) 30

4ο εξάμηνο σπουδών

•     Διπλωματική Εργασία (30 ECTS)

Σύνολο μονάδων (ECTS) 30

Το σύνολο των πιστωτικών μονάδων (ECTS) που απαιτούνται για την απόκτηση του Διπλώματος Μεταπτυχιακών Σπουδών φοίτησης (Δ.Μ.Σ.) είναι εκατόν είκοσι (120) ECTS.

Τα μαθήματα του ΠΜΣ «ΣΥΓΧΡΟΝΗ ΠΡΟΛΗΨΗ ΚΑΙ ΑΝΤΙΜΕΤΩΠΙΣΗ ΠΑΙΔΙΑΤΡΙΚΩΝ ΝΟΣΗΜΑΤΩΝ προγραμματίζονται να γίνονται κυρίως Παρασκευή, Σάββατο και Κυριακή προς διευκόλυνση των εργαζόμενων φοιτητών ενώ υπάρχει και η δυνατότητα της διδασκαλίας των θεωρητικών μαθημάτων με μέσα εξ αποστάσεως εκπαίδευσης σε ποσοστό 35% σύμφωνα με τις νόμιμες διατάξεις. Αναλυτικό πρόγραμμα παρακολούθησης μαθημάτων θα ανακοινωθεί πριν την έναρξη του ακαδημαϊκού εξαμήνου.

Η πρακτική άσκηση θα πραγματοποιείται στη Παιδιατρική Κλινική του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας είτε σε δομή Πρωτοβάθμιας Φροντίδας Υγείας που ασχολείται με τον τομέα της Παιδιατρικής. Η ενότητα της πρακτικής άσκησης θα αφορά συμμετοχή των Μ.Φ. στην λειτουργία των παραπάνω δομών και θα προγραμματίζονται έπειτα από συνεννόηση του φοιτητή με την Σ.Ε. και τους συνεργαζόμενους φορείς. Θα πρέπει να συμπληρωθούν 28 ώρες Πρακτικής Άσκησης σε κάθε ένα από τα τρία πρώτα εξάμηνα σπουδών. Φοιτητές που κατοικούν εκτός Λαρίσης, μπορούν κατόπιν συνεννόησης να οργανώσουν την άσκηση τους κοντά στον τόπο διαμονής τους.