Για την απονομή πτυχίου Μάστερ απαιτείται η επιτυχής ολοκλήρωση του προγράμματος σπουδών που συμπεριλαμβάνει και την επιτυχή ολοκλήρωση μιας Προχωρημένης Εργασίας, όπως περιγράφεται λεπτομερώς πιο κάτω. Η ελάχιστη διάρκεια του προγράμματος Μάστερ για φοιτητές πλήρους φοίτησης είναι τρία ακαδημαϊκά εξάμηνα (το θερινό εξάμηνο θεωρείται προαιρετικό και δεν λογίζεται ως επίσημο εξάμηνο του ΠΚ). Η μέγιστη επιτρεπόμενη διάρκεια για ολοκλήρωση του πτυχίου Μάστερ είναι τέσσερα χρόνια (8 εξάμηνα), όπως καθορίζεται από τους κανονισμούς του Πανεπιστημίου. Διευκρινίζεται ότι η Προχωρημένη Εργασία «Ενοποιημένος Σχεδιασμός Έργου» ξεκινά μόνο κάθε Σεπτέμβριο και ολοκληρώνεται κάθε Ιούλιο.

1. Μάστερ Μηχανικής (M.Eng)

Ο φόρτος εργασίας που οδηγεί στο πτυχίο Μάστερ M.Eng. απαιτεί τη συμπλήρωση τουλάχιστον 90 πιστωτικών μονάδων ECTS που να προέρχονται από συνδυασμό μαθημάτων μεταπτυχιακού επιπέδου, σεμιναρίων και εργασίας ως ακολούθως: 

Μαθήματα ειδίκευσης (40 ECTS)

• Μεταπτυχιακά μαθήματα ειδίκευσης εντός οικείου τμήματος (24 ECTS)
• Μεταπτυχιακά μαθήματα ειδίκευσης εκτός οικείου τμήματος (16 ECTS)

Μαθήματα γενικής επιλογής (24 ECTS)

• Μεταπτυχιακά μαθήματα εντός οικείου τμήματος
• Μεταπτυχιακά μαθήματα εντός πανεπιστημίου

Προχωρημένη Εργασία: Ενοποιημένος Σχεδιασμός Έργου (24 ECTS)

Μεταπτυχιακό Σεμινάριο (2 ECTS)

2. Μάστερ Επιστήμης (MSc)

Ο φόρτος εργασίας που οδηγεί στο πτυχίο Μάστερ M.Sc. απαιτεί τη συμπλήρωση τουλάχιστο 114 πιστωτικών μονάδων ECTS που να προέρχονται από συνδυασμό μαθημάτων μεταπτυχιακού επιπέδου, σεμιναρίων, προχωρημένης εργασίας και έρευνας διατριβής ως ακολούθως: 

Μαθήματα ειδίκευσης (32 ECTS)

• Μεταπτυχιακά μαθήματα ειδίκευσης εντός οικείου τμήματος (16 ECTS)
• Μεταπτυχιακά μαθήματα ειδίκευσης εκτός οικείου τμήματος (16 ECTS) 

Μαθήματα γενικής επιλογής (16 ECTS)

• Μεταπτυχιακά μαθήματα εντός οικείου τμήματος
• Μεταπτυχιακά μαθήματα εντός πανεπιστημίου 

Προχωρημένη Εργασία: Ενοποιημένος Σχεδιασμός Έργου (24 ECTS)

Μεταπτυχιακό Σεμινάριο (2 ECTS)

Έρευνα Διατριβής Μάστερ (40 ECTS) 

Κατάλογος Μεταπτυχιακών Μαθημάτων Ειδίκευσης

Τμήμα Αρχιτεκτονικής

• ΑΡΗ 511: Αρχιτεκτονική και Κριτική Ιστορία Οικολογίας (8 ECTS)
• ΑΡΗ 530: Προχωρημένη Τεχνολογία Κτιρίων (8 ECTS)
• ΑΡΗ 536: Προχωρημένη Τεχνολογία Οικοδομικών Υλικών (8 ECTS)
• ΑΡΗ 538: Περιβαλλοντικός Σχεδιασμός Κτιρίων (8 ECTS)
• ΑΡΗ 539: Εξειδικευμένα Θέματα Αρχιτεκτονικής Τεχνολογίας (8 ECTS)
• ΑΡΗ 540: Μεσογειακές Πόλεις και Κοινωνικά Ζητήματα (8 ECTS)
• ΑΡΗ 549: Εξειδικευμένα Θέματα Πολεοδομίας (8 ECTS)

Τμήμα Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Υπολογιστών

• ΗΜΥ 680: Ανάλυση Συστημάτων Ηλεκτρικής Ισχύος (8 ECTS)
• ΗΜΥ 681: Λειτουργία και Έλεγχος Συστημάτων Ηλεκτρικής Ισχύος (8 ECTS)
• ΗΜΥ 684: Ανάλυση Τεχνολογιών Παραγωγής Ηλεκτρικής Ενέργειας (8 ECTS)
• ΗΜΥ 685: Λειτουργία Συστημάτων Ηλεκτρικής Ισχύος (8 ECTS)
• ΗΜΥ 686: Μοντελοποίηση Συστημάτων Ηλεκτρικής Ισχύος (8 ECTS)
• ΗΜΥ 687: Κτιριακή Ενσωμάτωση Φωτοβολταϊκών Συστημάτων (8 ECTS) 
• ΗΜΥ 798: Εξειδικευμένα Θέματα Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Υπολογιστών (8 ΕCTS)

Τμήμα Μηχανικών Μηχανολογίας και Κατασκευαστικής

• ΜΜΚ 507: Εξειδικευμένα θέματα- Πρόγραμμα Ενέργειας (8 ΕCTS)
• ΜΜΚ 512: Προχωρημένη Θερμοδυναμική για Μηχανικούς (8 ECTS)
• ΜΜΚ 516: Τεχνολογία Ανανεώσιμων Πηγών Ενέργειας (8 ECTS)
• ΜΜΚ 517: Συστήματα Ηλιακής Ενέργειας (8 ECTS)
• ΜΜΚ 566: Ανώτερη Θεωρία Ημιαγωγών και Φωτοβολταϊκά Στοιχεία (8 ECTS)
• ΜΜΚ 567: Υλικά για Παραγωγή, Αποθήκευση και Μετατροπή Ενέργειας (8 ECTS)

Τμήμα Πολιτικών Μηχανικών και Μηχανικών Περιβάλλοντος

• ΠΠΜ 536: Ενεργειακή Απόδοση Κτιρίων (8 ECTS)
• ΠΠΜ 546: Δομική Φυσική (8 ECTS)
• ΠΠΜ 576: Περιβαλλοντική Ρευστομηχανική (8 ECTS)
• ΠΠΜ 580: Δυναμική της Ατμόσφαιρας και Διασπορά Αέριας Ρύπανσης (8 ECTS)
• ΠΠΜ 586: Αειφόρο Δομημένο Περιβάλλον (8 ECTS)
• ΠΠΜ 596: Διαχείριση Ανανεώσιμων Πηγών Ενέργειας (8 ECTS)

Κατάλογος Προπτυχιακών Μαθημάτων Γενικής Επιλογής

Τμήμα Αρχιτεκτονικής

• ΑΡΗ 412: Αρχιτεκτονική και Κριτική Ιστορία Οικολογίας (5 ECTS)

Τμήμα Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Υπολογιστών

• ΗΜΥ 340: Μηχανική Ηλεκτρικής Ισχύος (6 ECTS)
• ΗΜΥ 447: Ανανεώσιμες πηγές ενέργειας: Φωτοβολταϊκά (6 ECTS)

Τμήμα Μηχανικών Μηχανολογίας και Κατασκευαστικής

• ΜΜΚ 217: Μεταφορά Θερμότητας (6 ECTS)

Τμήμα Πολιτικών Μηχανικών και Μηχανικών Περιβάλλοντος

• ΠΠΜ 483: Φαινόμενα Μεταφοράς στη Μηχανική Περιβάλλοντος (5 ECTS)