Για την απονομή πτυχίου Μάστερ απαιτείται η επιτυχής ολοκλήρωση του προγράμματος σπουδών που συμπεριλαμβάνει και την επιτυχή ολοκλήρωση μιας Προχωρημένης Εργασίας, όπως περιγράφεται λεπτομερώς πιο κάτω. Το πρόγραμμα προσφέρεται στην αγγλική γλώσσα και η ελάχιστη διάρκεια του προγράμματος Μάστερ για φοιτητές και φοιτήτριες πλήρους φοίτησης είναι τρία ακαδημαϊκά εξάμηνα (το θερινό εξάμηνο θεωρείται προαιρετικό και δεν λογίζεται ως επίσημο εξάμηνο του ΠΚ). Η μέγιστη επιτρεπόμενη διάρκεια για ολοκλήρωση του πτυχίου Μάστερ είναι τέσσερα χρόνια (8 εξάμηνα), όπως καθορίζεται από τους κανονισμούς του Πανεπιστημίου. Διευκρινίζεται ότι η Προχωρημένη Εργασία «Ενοποιημένος Σχεδιασμός και Έρευνα Έργου» ξεκινά μόνο κάθε Σεπτέμβριο και ολοκληρώνεται κάθε Ιούλιο.
 
1. Μάστερ Μηχανικής (M.Eng)
Ο φόρτος εργασίας που οδηγεί στο πτυχίο Μάστερ M.Eng. απαιτεί τη συμπλήρωση τουλάχιστον 90 ECTS που να προέρχονται από συνδυασμό μαθημάτων μεταπτυχιακού επιπέδου, σεμιναρίων και εργασίας ως ακολούθως: 
 
Μαθήματα ειδίκευσης-Κοινού Κορμού (Υποχρεωτικά 66 ECTS)

• ΠΟΛ 500 Αρχές Διεπιστημονικής Μηχανικής- προπαρασκευαστικό 1 ECTS
• ΑΡΗ 538 Περιβαλλοντικός Σχεδιασμός Κτιρίων 8 ECTS
• HMY 687 Κτιριακή Ενσωμάτωση Φωτοβολταϊκών Συστημάτων (PV) 8 ECTS
• MMK 516 Τεχνολογία Ανανεώσιμων Πηγών Ενέργειας 8 ECTS
• ΠΠΜ 536 Ενεργειακή Απόδοση Κτιρίων 8 ECTS
• Προχωρημένη Εργασία: Ενοποιημένος Σχεδιασμός και Έρευνα Έργου 24 ECTS
• Μεταπτυχιακό Σεμινάριο 1 ECTS
• Εμπλοκή με την Επαγγελματική Πρακτική και Βιομηχανία 1 ECTS

Μαθήματα ειδίκευσης – Επιλογής (24 ECTS)
4 μαθήματα επιλογής 4Χ8=32 ECTS
 
2. Μάστερ Επιστήμης (MSc)
Ο φόρτος εργασίας που οδηγεί στο πτυχίο Μάστερ M.Sc. απαιτεί τη συμπλήρωση τουλάχιστο 96 ECTS που να προέρχονται από συνδυασμό μαθημάτων μεταπτυχιακού επιπέδου, σεμιναρίων, προχωρημένης εργασίας και έρευνας διατριβής ως ακολούθως: 
 
Μαθήματα ειδίκευσης-Κοινού Κορμού (Υποχρεωτικά)

• ΠΟΛ 500 Αρχές Διεπιστημονικής Μηχανικής- προπαρασκευαστικό 1 ECTS
• ΠΟΛ 800 Μεθοδολογίες της Έρευνας 8 ECTS
• ΑΡΗ 538 Περιβαλλοντικός Σχεδιασμός Κτιρίων 8 ECTS
• HMY 687 Κτιριακή Ενσωμάτωση Φωτοβολταϊκών Συστημάτων (PV) 8 ECTS
• MMK 516 Τεχνολογία Ανανεώσιμων Πηγών Ενέργειας 8 ECTS
• ΠΠΜ 536 Ενεργειακή Απόδοση Κτιρίων 8 ECTS
• Προχωρημένη Εργασία: Ενοποιημένος Σχεδιασμός και Έρευνα Έργου 24 ECTS
• Μεταπτυχιακό Σεμινάριο 1 ECTS
• Εμπλοκή με την Επαγγελματική Πρακτική και Βιομηχανία 1 ECTS
• Έρευνα Διατριβής Μάστερ 40 ECTS

 
Κατάλογος Μεταπτυχιακών Μαθημάτων Κοινού Κορμού (Υποχρεωτικά)
 
Τμήμα Αρχιτεκτονικής
ΑΡΗ 538: Περιβαλλοντικός Σχεδιασμός Κτιρίων (8 ECTS)
Τμήμα Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Υπολογιστών
HMY 687 Κτιριακή ενσωμάτωση φωτοβολταϊκών συστημάτων (PV) (8 ECTS)
Τμήμα Μηχανικών Μηχανολογίας και Κατασκευαστικής
ΜΜΚ 516: Τεχνολογία Ανανεώσιμων Πηγών Ενέργειας (8 ECTS)
Τμήμα Πολιτικών Μηχανικών και Μηχανικών Περιβάλλοντος
ΠΠΜ 536: Ενεργειακή Απόδοση Κτιρίων (8 ECTS)
Μεταπτυχιακό Διατμηματικό Πρόγραμμα ΕΤΑΣ
ΠΟΛ 500: Αρχές Διεπιστημονικής Μηχανικής (1 ECTS)- Προπαρασκευαστικό
ΠΟΛ 700: Εμπλοκή με την Επαγγελματική Πρακτική και Βιομηχανία (1 ECTS)
ΠΟΛ 604: Προχωρημένη Εργασία: Ενοποιημένος Σχεδιασμός και Έρευνα Έργου Ι (6 ΕCTS)
ΠΟΛ 704: Προχωρημένη Εργασία: Ενοποιημένος Σχεδιασμός και Έρευνα Έργου ΙΙ (8 ΕCTS)
ΠΟΛ 800: Μεθοδολογίες Έρευνας (8 ΕCTS)
ΠΟΛ 601: Μεταπτυχιακό Σεμινάριο (1 ECTS)
ΠΟΛ 804: Προχωρημένη Εργασία: Ενοποιημένος Σχεδιασμός και Έρευνα Έργου ΙΙΙ (10 ΕCTS)
 
Κατάλογος Μεταπτυχιακών Μαθημάτων Ειδίκευσης (Επιλογής)
 
Τμήμα Αρχιτεκτονικής
ΑΡΗ 539: Εξειδικευμένα Θέματα Αρχιτεκτονικής Τεχνολογίας (8 ECTS)
ΑΡΗ 549: Εξειδικευμένα Θέματα Πολεοδομίας(8 ECTS)
ΑΡΗ 550: Ειδικά Θέματα Καταγραφής και Τεκμηρίωσης Κτηρίων και Συνόλων (8 ECTS)
Τμήμα Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Υπολογιστών
ΗΜΥ 680: Ανάλυση Συστημάτων Ηλεκτρικής Ισχύος (8 ECTS)
ΗΜΥ 681: Λειτουργία και Έλεγχος Συστημάτων Ηλεκτρικής Ισχύος (8 ECTS)
ΗΜΥ 685: Λειτουργία Συστημάτων Ηλεκτρικής Ισχύος (8 ECTS)
ΗΜΥ 686: Μοντελοποίηση Συστημάτων Ηλεκτρικής Ισχύος (8 ECTS)
ΗΜΥ 688: Operation and Economics of Sustainable Power Systems (8 ECTS)         
Τμήμα Μηχανικών Μηχανολογίας και Κατασκευαστικής
MMK 512 Προχωρημένη Θερμοδυναμική για Μηχανικoύς (8 ECTS)
MMK 517 Συστήματα Ηλιακής Ενέργειας (8 ECTS)
ΜΜΚ 566: Advanced Semiconductor Materials and Nanodevices (8 ECTS)
Τμήμα Πολιτικών Μηχανικών και Μηχανικών Περιβάλλοντος
ΠΠΜ 586: Αειφόρο Δομημένο Περιβάλλον (8 ECTS)
ΠΠΜ 596: Θαλάσσια και Αιολική Ενέργεια (8 ECTS)
ΠΠΜ 598: Βιοτεχνολογική παραγωγή βιοκαυσίμων και βιοενέγειας (8 ECTS)