Το Π.Μ.Σ. «Διοίκηση Τουριστικών Επιχειρήσεων» διαρθρώνεται σε δύο (2) ακαδημαϊκά έτη, τα οποία περιλαμβάνουν τέσσερις (4) θεματικές ενότητες και εκπόνηση διπλωματικής εργασίας. Για την απόκτηση του ΜΔΕ είναι υποχρεωτική η επιτυχής παρακολούθηση τεσσάρων θεματικών ενοτήτων καθώς επίσης και η επιτυχής ολοκλήρωση της Μεταπτυχιακής Διπλωματικής Εργασίας. Η ελάχιστη χρονική διάρκεια για την ολοκλήρωση του προγράμματος είναι δύο (2) έτη. Το σύνολο των πιστωτικών μονάδων (ECTS) που απαιτούνται για την απόκτηση του Μεταπτυχιακού Διπλώματος Ειδίκευσης (Μ.Δ.Ε.) είναι 120 ECTS.

1^ο Έτος

• Γενικές Αρχές Μάνατζμεντ, Τουριστική Νομοθεσία και Οργάνωση Εργοδοτικών και  Συλλογικών Φορέων Τουρισμού
• Τουριστικός Τομέας
• Διοίκηση Τουρισμού και Τουριστικών Επιχειρήσεων
• Τουριστικό Μάρκετινγκ Φορέων, Οργανώσεων και Επιχειρήσεων 

2^ο Έτος

• Διοίκηση Τουρισμού και Τουριστικών Επιχειρήσεων
• Τουριστικό Μάρκετινγκ Φορέων, Οργανώσεων και Επιχειρήσεων 
• Μεταπτυχιακή Διπλωματική Εργασία