Το σύνολο των Πιστωτικών Μονάδων (ECTS) που απαιτούνται για την απόκτηση του Δ.Μ.Σ. ανέρχονται σε 75. Η εκπόνηση Διπλωματικής Εργασίας (Δ.Ε.) είναι υποχρεωτική και αντιστοιχεί σε τριάντα (30) ECTS.

Τα προσφερόμενα στο πρόγραμμα μεταπτυχιακών σπουδών του Τμήματος μαθήματα διακρίνονται σε υποχρεωτικά, και σε κατ' επιλογή υποχρεωτικά μαθήματα. Κάθε μάθημα, υποχρεωτικό ή κατ' επιλογή υποχρεωτικό, διδάσκεται τρεις ώρες εβδομαδιαίως και περιλαμβάνει συνολικά δεκατρείς (13) διαλέξεις. Μέρος κάθε μαθήματος μπορεί να διδάσκεται υπό μορφή εργαστηριακών ή πρακτικών ασκήσεων.

ΕΙΔΙΚΕΥΣΗ Α΄ «Επιστημών Φυτών και Περιβάλλοντος»

Α` Εξάμηνο 

• Νέες-Εναλλακτικές Καλλιέργειες (7,5 ECTS)
• Ολοκληρωμένη Διαχείριση Εχθρών των Φυτών (7,5 ECTS) 
• Φυσιολογία Καρποφόρων Δένδρων (7,5 ECTS)
• Διπλωματική Εργασία (έναρξη) (7,5 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS

Β` Εξάμηνο 

• Ρύπανση Αγροοικοσυστημάτων (7,5 ECTS)
• Διπλωματική Εργασία (7,5 ECTS)

και δύο από τα παρακάτω: 

• Αλληλεπιδράσεις Εντόμων-Φυτών (7,5 ECTS)
• Βιοτεχνολογία Φυτών (7,5 ECTS)
• Φυσιολογία Απόδοσης Καλλιεργειών (7,5 ECTS)
• Ειδική Θέματα Φυτοπαθολογίας (7,5 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS

Θερινή περίοδος

• Διπλωματική Εργασία (15 ECTS)

Σύνολο 15 ECTS

ΕΙΔΙΚΕΥΣΗ Β' «Οικονομική των Επιχειρήσεων Αγροτικών Προϊόντων και Τροφίμων»

Α` Εξάμηνο 

• Μάρκετινγκ (7,5 ECTS)
• Ειδικά Θέματα Επιχειρησιακής Έρευνας (7,5 ECTS) 
• Διεθνές Εμπόριο και Πολιτική (7,5 ECTS)
• Θέματα Μικροοικονομικής Θεωρίας: Λειτουργία Αγορών και Οικονομική Επιχειρήσεων Τροφίμων (7,5 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS

Β` Εξάμηνο 

• Ειδικά Θέματα Διοίκησης Επιχειρήσεων Τροφίμων (7,5 ECTS)
• Μέθοδοι και Εφαρμογές Επιχειρηματικής Έρευνας (7,5 ECTS)
• Διπλωματική Εργασία (έναρξη) (15 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS

Θερινή περίοδος

• Διπλωματική Εργασία (15 ECTS)

Σύνολο 15 ECTS

ΕΙΔΙΚΕΥΣΗ Γ' «Βιοτεχνολογίας και Υγιεινής Τροφίμων»

Α` Εξάμηνο 

• Ειδικά κεφάλαια βιοτεχνολογίας τροφίμων (7,5 ECTS)
• Βιομηχανική Υγιεινή (7,5 ECTS) 
• Ειδικά θέματα διατροφής (7,5 ECTS)
• Διπλωματική Εργασία (έναρξη) (7,5 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS

Β` Εξάμηνο 

• Θέματα Υγιεινής και Ασφάλειας Τροφίμων και Ύδατος (7,5 ECTS)
• Χημεία φυσικών προϊόντων και εφαρμογές (7,5 ECTS)
• Ειδικά θέματα Επιστήμης και Τεχνολογίας Τροφίμων (7,5 ECTS)
• Διπλωματική Εργασία (έναρξη) (7,5 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS

Θερινή περίοδος

• Διπλωματική Εργασία (15 ECTS)

Σύνολο 15 ECTS