Το σύνολο των πιστωτικών μονάδων (ECTS) που απαιτούνται για την απόκτηση του Διπλώματος Μεταπτυχιακών Σπουδών Δ.Μ.Σ. είναι 120 ECTS. Το αναλυτικό πρόγραμμα μαθημάτων ανά εξάμηνο διαμορφώνεται ως εξής:

Α΄ Εξάμηνο

• Ετεροκυκλική Φαρμακοχημεία υποχρεωτικό (10 ECTS)
• Προχωρημένα Μηθήματα Μεταβολισμού Ξενοβιοτικών υποχρεωτικό (10 ECTS)
• Προχωρημένη Φαρμακοχημεία (10 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS 

Β΄ Εξάμηνο

• Χημική Βιολογία Ενώσεων Φαρμακευτικού Ενδιαφέροντος υποχρεωτικό (10 ECTS)
• Βιομηχανική Φαρμακοχημεία υποχρεωτικό (10 ECTS)
• Αναλυτική Φαρμακοχημεία, Διευκρίνηση Δομής Φαρμακευτικών Ενώσεων (10 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS 

Γ΄ Εξάμηνο

• Εργαστηριακή Μεταπτυχιακή έρευνα Ι (30 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS 

Δ΄ Εξάμηνο

• Εργαστηριακή Μεταπτυχιακή έρευνα ΙΙ υποχρεωτικό (20 ECTS)
• Συγγραφή και παρουσίαση μεταπτυχιακής Διπλωματικής Εργασίας (10 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS 

Η γλώσσα διδασκαλίας του Προγράμματος είναι η ελληνική.